Na época 1948/49 os clubes do Distrito de Beja presentes nos Campeonatos Nacionais de Futebol foram:
2ª Divisão
- Clube Desportivo de Beja - Grupo D - 2ºClassificado
- Moura Atlético Clube - Grupo D - 8ºClassificado
3ª Divisão
- Sport Clube Mineiro Aljustrelense - Oitavos-de-Final
