Na época 1965/66 os clubes do Distrito de Beja presentes nos Campeonatos Nacionais de Futebol foram:
2ª Divisão
- Clube Desportivo de Beja - Zona Sul - 14ºClassificado
3ª Divisão
- Futebol Clube de Serpa - Série 8 - 4ºClassificado
- Moura Atlético Clube - Série 8 - 5ºClassificado
- Sporting Clube Santaclarense - Série 8 - 6ºClassificado
