Na época 2005/2006 os clubes do Distrito de Beja presentes nos Campeonatos Nacionais de Futebol foram:
3ª Divisão
- Clube Desportivo de Beja - Série F - 9ºClassificado
- Sport Clube Mineiro Aljustrelense - Série F - 14ºClassificado
- Futebol Clube Castrense - Série F - 16ºClassificado
