Na época 2011/2012 os clubes do Distrito de Beja presentes nos Campeonatos Nacionais de Futebol foram:
2ª Divisão "B"
- Moura Atlético Clube - Zona Sul - 15ºClassificado
3ª Divisão
- Sport Clube Mineiro Aljustrelense - Série F - 4ºClassificado
- Despertar Sport Clube - Série F - 12ºClassificado