Na época 2012/2013 os clubes do Distrito de Beja presentes nos Campeonatos Nacionais de Futebol foram:
3ª Divisão
- Moura Atlético Clube - Série F - 3ºClassificado
- Clube de Futebol Vasco da Gama da Vidigueira - Série F - 6ºClassificado
- Sport Clube Mineiro Aljustrelense - Série F - 7ºClassificado
- Futebol Clube Castrense - Série F - 8ºClassificado
